UPI यूज़र्स और छोटे कारोबारियों के लिए फिलहाल फ्री रहेगा, लेकिन भविष्य में अगर बड़े मर्चेंट्स पर ट्रांजैक्शन फीस लगती है तो वे इसका खर्च ग्राहकों पर डाल सकते हैं। एक्सपर्ट्स के मुताबिक, मर्चेंट इस शुल्क को खुद वहन करने के बजाय सामान और सेवाओं की कीमत में जोड़ सकते हैं, जिससे ग्राहकों पर इसका अप्रत्यक्ष असर पड़ सकता है।